红豆草品种特异性、一致性和稳定性测试指南的研制
植物品种DUS (Distinctness,Uniformity and Stability)测试是植物新品种审定、登记的必要环节。DUS 测试指南是品种审定机构开展DUS测试的基本依据。本研究按照国际植物新品种保护联盟(UPOV)技术文件《TGP/7 植物新品种测试指南的研制》规定的程序要求,以90份红豆草(Onobrychis viciifolia)品种资源为试验材料,在新疆乌鲁木齐开展了两年的田间试验,经过多次同行专家论证修订,完成了红豆草DUS测试指南报批稿。指南规定了红豆草DUS测试的31个测试性状及其观测方法和判定标准,13个标准品种,并详细介绍了红豆草DUS测试指南研制的过程及指南的主要内容。指南的制订为国内红豆草新品种特异性、一致性和稳定性的判定提供了技术依据,对加强我国红豆草新品种保护具有重要意义,为红豆草产业健康发展提供技术保障。
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干旱与半干旱地区正面临着前所未有的挑战,尤其是城市草地的维持与管理。这些地区因自然降水稀少和蒸发强烈,城市草地生态系统往往处于脆弱状态。随着城市化进程的加速,城市草地的作用日益凸显,它们不仅是“城市之肺”,更是城市生态系统的重要组成部分。在这一背景下,高效和准确地监测城市草地的变化,对于草地退化的早期预警和有效管理至关重要,而草本植物的识别可以为草地监测提供重要的判断信息。
传统的草本植物识别依赖于专家的目视判断和经验积累,这种方法不仅效率低下且成本高昂,难以满足大规模和高精度的监测需求。随着模式识别技术的发展,基于机器的图像分类方法得到广泛应用。这些方法基于特定的图像处理算法提取特征,并利用分类器对这些特征进行数学分析以得出分类结果[1]。然而,这种方法不仅需要丰富的专业知识,还要求具备一定的分类经验和实验研究。因此,在数据集的制作和特征提取方面都面临一定的挑战,缺乏普适性。
随着人工智能技术的发展,深度学习为草本植物识别提供了新的解决方案。近年来,基于Transformer模型[2]的视觉模型,如ViT (Vision Transformer)[3],通过多头注意力机制获取全局信息,在图像分类任务中展现出卓越的性能。例如,刘金宇等[4]首次将ViT应用于荒漠草原微斑块识别,有效提升了识别精度。王杨等[5]改进了ViT模型缺乏局部归纳偏置和自注意力过于关注自身的问题,提出了更适合农作物病害识别的方法。此外,陈少真等[6]将知识蒸馏与改进的ViT网络相结合,实现了高精度的花卉图像细粒度分类。Testagrose等[7]比较了ViT模型和两种不同的EfficientNet模型在自动沼泽草识别中的表现,结果显示使用ViT可以提高沼泽草识别的准确性。这些研究表明,ViT及其衍生模型在图像识别领域具有强大的泛化能力和应用潜力。然而,ViT在细节特征提取方面存在局限,对小数据集的泛化能力可能较弱,且计算量较大[8]。Lee等[9]结合卷积神经网络和ViT,增强了单一模型的能力,在植物分类领域取得了较高的准确率。
与此同时,深度残差网络(residual network 50 layers,ResNet50 [10])等卷积神经网络(convolutional neural networks,CNNs)架构也是计算机视觉领域的强大工具。Mukti等[11]利用ResNet50对38种健康叶子和病害叶子进行分类,取得了高达99.80%的准确率。Al-Gaashani等[12]提出的基于ResNet50的自注意力网络(self-attention net,SANET)在水稻(Oryza sativa)病害诊断中提高了效率和有效性。Liang等[13]采用ResNet50网络结合双路径注意力机制和随机池化方法,有效消除了非最大值的影响,使模型在番茄(Solanum lycopersicum)叶病分类任务中达到了99.28%的准确率。Du等[14]利用改进的ResNet50网络对棉(Gossypium)籽质量进行检测,其模型平均检测精度达到97.23%,单张图像处理时间缩短至0.11 s,满足了对棉籽品质进行快速准确检测的需求。Wang等[15]使用改进的ResNet50对玉米(Zea mays)病害进行了分类研究,分别在数据集和农田图像上的识别准确率达到98.52%和97.83%,平均识别速度为204 ms,为玉米田喷洒设备的研发提供了技术支持。这些研究证实了ResNet50在特征提取方面的强大能力,尤其在植物分类和识别任务中表现出色。然而,深度残差网络的计算效率较低,在训练数据不足时易发生过拟合,且需要大量标注数据[16]。为了解决这些问题,Abdulsalam等[17]结合预训练的ResNet50和YOLO v2对象检测器,组成混合网络来改进农田杂草检测和分类的效果。Han等[18]提出了边缘自编码网络(edge autoencoder network,E-A-Net)算法,与原始的ResNet50网络结合,进一步提高了ResNet50的准确率。
尽管现有研究在草本植物识别方面取得了一定进展,但仍面临诸多挑战,如模型训练周期过长、对大规模数据集的依赖、识别精度提升空间有限,以及在实际应用中数据集偏重的问题。本研究旨在结合ViT和ResNet50这两种先进的图像识别模型,构建一种针对干旱和半干旱城市草地监测的高效模型。该模型结合了ViT的全局注意力机制和ResNet50的强大特征提取能力,希望在保持高准确率的同时,提高模型的训练效率和适应性。希望此模型为干旱和半干旱城市草地的监测和管理提供新的解决方案,并促进类似区域的生态环境保护和改善。
1. 数据与研究方法
1.1 数据
采用原创数据集进行试验,数据集由
1100 张图片组成,拍摄于内蒙古自治区呼和浩特市内蒙古大学校园内,于北京时间2023年4月20日12:30开始拍摄,此时光线充足,拍摄效果良好。拍摄设备是佳能EOS80D相机搭配佳能EF-S 18-200 mm f3.5-5.6 IS变焦镜头。选择的草本植物是在内蒙古大学校园内普遍存在的草本植物,从这些草本植物的数量来说,是校园内生态系统影响的主要因素。其次,选择的种类也是基于对照片内容的全面分析和领域专业知识,其在形态学上差异较为明显,方便在分类时和预测后通过目视的方式进行分类及验证结果的正确性。同时也希望通过这些具有代表性的草本植物来验证和测试ResVit模型的分类性能。最后,考虑到计算资源的限制和模型训练的时间成本,将类别控制在一个合理的范围内,以确保模型能够高效地训练并保持良好的泛化能力。
为了模拟真实情况,采用随机拍摄的方式进行照片采集。收集到的照片被整理并分为16类:A类齿果酸模(Rumex crispus) 108张,B类狭苞斑种草(Spodiopogon stenochloa) 76张,C类早开堇菜(Viola prionantha) 74张,D类扁秆葟草(Arthraxon compressus) 68张,E类细叶葟草(A. hispidus) 67张,F类金焰绣线菊(Spiraea bumalda ‘Gold Flame’) 64张,G类宽叶葟草(Arthraxon macrophyllus) 62张,H类珍珠梅(Sorbaria sorbifolia) 61张,I类老鹳草(Geranium wilfordii) 31张,J类黄花蒿(Artemisia annua) 51张,K类马蔺(Iris lactea) 48张,L类蜀葵(Alcea rosea) 52张,M类北美独行菜(Lepidium virginicum) 37张,N类蒲公英(Taraxacum mongolicum) 49张,O类独行菜(Lepidium apetalum) 28张和其他类(P类) 224张,总计
1100 张照片。这些照片被汇总生成数据表单,作为原始数据集。其中,其他类照片是数据集中数量最多的类别(优势类),用于在数据集存在偏重的情况下测试模型的分类能力。A-O类照片如图1所示。将原始数据集按照8 ꞉ 1 ꞉ 1的比例划分为训练集、验证集和测试集,分别包含880张、110张和110张图片。将
1100 张照片进行数据增强,采用的增强方式包括缩放、旋转、平移和混合模式(前3种模式的组合)。以A类照片为例,4种增强方式的示例如图2所示。单张照片通过1种增强方式生成3张不同的增强照片(图3),4种增强方式最终生成12张增强照片。1100 张照片总计生成13200 张增强照片。这些增强照片被汇总生成数据表单,作为增强数据集。增强数据集的目的是通过多样化数据来提升模型的泛化能力,使其能够更好地识别不同形式和角度的同类照片。为了保证测试集的严谨性,防止产生泄题,导致模型提前学习到要测试的内容,将原数据集中划分出来的测试集部分和测试集产生的增强数据集部分进行隔离,使其不加入到训练集中。1.2 研究方法
1.2.1 ResNet50网络
ResNet在2015年被提出[19],并在ImageNet比赛的分类任务中获得了第1名。ResNet是一种经典的卷积神经网络,它的核心思想是引入残差学习,解决深层网络训练中的梯度消失和梯度爆炸问题。通过在网络中添加直接的前向连接(即残差连接),ResNet使得梯度可以直接通过这些连接流动,从而支持训练更深的网络。
本研究主要参考了ResNet系列模型中的ResNet50 [11]模型,该模型在植物分类方面具有出色的特征提取能力。ResNet50的网络结构主要由卷积块(convolutional block)和恒等块(identity block)两个模块组合而成。其中,卷积块由3层卷积层构成。第1层使用1 × 1卷积核,主要用于降低维度,有时也用于改变维度;第2层使用3 × 3卷积核,进行特征提取,并设置步长为2以实现下采样;第3层使用1 × 1卷积核,用于恢复维度。而恒等块也由3层卷积层组成。第1层同样使用1 × 1卷积核,主要用于降低维度;第2层使用3 × 3卷积核,是主要的特征提取层;第3层使用1 × 1卷积核,用于恢复维度。这样的设计使得整体网络更易于训练,并且相较于同系列的其他模型。ResNet50拥有更深的网络结构,因此在图像分类任务上表现优异。本研究主要使用了ResNet50模型的特征提取部分,舍弃了后半部分的全连接层。为了更好地反映其来源和特性,将该特征提取部分命名为Res50Ftr。
1.2.2 ViT模型及其变种
1) ViT模型。
ViT (vision transformer)模型[3]是Google团队于2020年提出的一种将Transformer [2]应用于图像分类的模型。ViT的主要特点是简单且高效。它通过将图像分割成小块(patches),并将每个patch视为序列的输入,从而将图像分类任务转化为序列处理任务。这种方法不仅使模型能够捕捉到图像中的空间关系,还允许Transformer模型直接在图像数据上工作,而不依赖于卷积神经网络的归纳偏差。在大规模数据集上训练时,ViT模型的性能可以达到或超过传统的卷积神经网络。由于其自注意力机制,ViT在处理不同尺寸和比例的图像时展现出较好的灵活性和泛化能力。
2) ViT模型变种。
ViT模型在图像分类方面表现出色,但也存在一些局限性,如需要大规模数据集进行训练。为了解决这一问题,研究人员开发了专为小数据集优化的衍生ViT模型[20],称为ViTSmall。这款模型在保持良好分类性能的同时,降低了对数据集规模的要求,从而减少了各领域从业者在前期数据准备方面的难度,并节省了大量时间。
ViTSmall模型在设计上与原始的ViT模型有所不同,它采用了局部化自注意力(locally sensitive attention, LSA)和平移分块嵌入(shifted patch tokenization,SPT)类,这两个类在参数数量和计算效率方面进行了优化。LSA类是一种改良的注意力机制,旨在增强模型对局部特征的敏感性,通过对点积结果应用温度缩放来提高注意力机制的稳定性和效果。SPT类则通过对图像进行空间位移来丰富patch的表示,这不仅简化了图像的分块处理,还增强了模型对位置信息的感知能力。
3) ResViT模型。
本研究将Res50Ftr和ViTSmall模型结合,形成一个新的模型,命名为ResViT。在这个组合中,Res50Ftr模型负责提取全局特征,然后将这些特征输入到ViTSmall模型中进行局部特征的提取。这样,整个模型的特征提取能力得到了最大化,增强了模型的学习能力和分类准确性。即使在小规模数据集上,ResViT仍能保持对图像分类的高精度。因此,ResViT不仅弥补了原始ViT在数据集规模方面的不足,还确保了图像分类的准确性。
ResViT模型的输入是像素为244 × 244 × 3的RGB图像,范围为0~255像素。在训练前,需要对图像进行预处理,将其缩放至像素为244 × 244的大小。图像进入模型后,首先通过Res50Ftr部分,该部分包括一个卷积核大小为7 × 7、步长为2的卷积层,接着是4个瓶颈卷积块(bottleneck block)。每个瓶颈卷积块由多个1 × 1和3 × 3的卷积层以及ReLU激活函数组成,旨在减少网络参数并提高模型性能。然后,通过全局池化层生成一个像素为7 × 7 ×
2 048 的特征图。接下来,这个特征图输入到SPT部分。SPT部分对特征图进行上下左右4个方向的平移,目的是增强局部上下文信息。通过这种平移操作,每个图像块可以获取更多的邻近信息,从而提高模型对局部特征的捕捉能力。然后,将平移后的特征图与原特征图进行拼接,生成一个像素为49 ×1 024 的新特征图,这个新特征图将输入到ViTSmall中。在ViTSmall中,新特征图首先被分割,并编入位置信息。在Transformer中,通过LSA机制强调局部特征并限制注意力的计算范围,以减少计算复杂度和过拟合的风险。最终,模型输出分类结果。整体模型流程如图4所示。2. 实验结果
本研究除了测试ResViT模型外,还选择AlexNet、ResNet50和VGG19作为对比实验,以验证ResViT模型在草地分类识别中的准确性和训练时长是否具有优势。在实验中,将预处理后的224 × 224像素大小的RGB图像输入到ResViT模型,并按照1.2.3节中描述的流程开展实验。
2.1 参数设置
图像块的大小(patch_size)设置为7,类别数(num_classes)为16,通道数(channels)为3,模型隐藏维度(dim)为
1024 ,Transformer块的数量(depth)为6,注意力头数(heads)为8,多层感知器(multi-layer perceptron,MLP)的隐藏层维度(mlp_dim)为2 048,训练轮数(epoch)设置为70。使用了Adam优化器,初始学习率为0.003,并采用CrossEntropyLoss函数作为损失函数。2.2 评价指标
计算准确率($ \text{A}\text{ccuracy} $):
$$ Accuracy=\dfrac{TP+TN}{TP+TN+FP+FN}\text{ 。} $$ 式中:$ {TP} $表示实际为正类且被模型正确预测为正类的样本数,$ {TN} $ 表示实际为负类且被模型正确预测为负类的样本数,$ {FP} $ 表示实际为负类但被模型错误预测为正类的样本数,$ {FN} $表示实际为正类但被模型错误预测为负类的样本数。
为更好地评估模型性能,在训练集和验证集评价过程中使用了平均准确率(Average_accuracy)。
$$ Average_-accuracy=\dfrac{Accuracy}{Epoch}\ 。 $$ 式中:Epoch为实验轮数,本研究中各个模型训练集和验证集的实验轮数均为70轮,测试集轮数为1轮,即测试集的准确率应等同于其平均准确率。通过平均准确率更可以反映出模型的学习效率。
由于本试验涉及多分类问题,因此使用的召回率($ \text{Recall} $)计算方法是先计算单个类别的召回率,然后取这些召回率的平均值作为最终的召回率。单个类别的召回率的计算公式为:
$$ Recall_i=\dfrac{TP_i}{TP_i+FN_i}\ 。 $$ 式中:$ {Recall}_{i} $表示第$ {{i}} $类的召回率;$ {TP}_{i} $表示实际为第 $ {{i}} $类且被模型正确预测为第 $ {i} $类的样本数;$ {FN}_{i} $表示实际为第i类但被模型错误预测为其他类别的样本数。平均召回率($ \text{Recall\_mean} $)的计算公式为:
$$ Recall\_mean=\dfrac{\displaystyle\sum_{i=1}^nRecall_i}{num\_classes}\ 。 $$ 本研究采用宏平均(Macro-average) $ \text{F1} $评分的计算方法,首先计算每个类别的精确率($ \text{Precision} $)和召回率。每个类别的精确率计算公式为:
$$ Precision_i=\dfrac{TP_i}{TP_i+FP_i}\ 。 $$ 式中:$ {Precision}_{i} $表示第i类的精确率;$ {FP}_{i} $表示实际不为第i类但被模型错误预测为第i类的样本数。然后计算平均精确率($ \text{Precision\_mean} $):
$$ Precision\_mean=\dfrac{\displaystyle\sum_{i=1}^nPrecision_i}{num\_classes}\ ; $$ $$ F1=2\times\dfrac{Precision\_mean\times Recall\_mean}{Precision\_mean+Recall\_mean}\ 。 $$ 将经过70轮训练后轮次模型达到最优时的参数作为最终的模型参数。使用这些参数在测试集上进行测试,并将测试结果作为模型的最终准确率标准。
2.3 实验环境
本实验在Linux操作系统(CentOS 7.6)上进行,使用Python 3.8.8和PyTorch 2.2.2深度学习框架。硬件配置为:Intel Xeon Gold 6254处理器(2颗,18核,3.1 GHz)和192 GB内存。
3. 结果
如表1所列,经过70轮训练后,ResViT模型训练集和验证集的平均准确率均为最高,分别达到了97.02%和97.25%,其测试集的准确率也为4个模型中最高(95.45%)。由此可见,ResViT模型在16类分类的任务中仍然可以出色的完成任务。此外,AlexNet模型的准确率最低,在训练集和验证集上的平均准确率仅有78.02%和81.05%。ResNet50模型的准确率排名第二,分别为96.78%和96.97%。在召回率方面,ResViT模型的平均召回率为96.32%,显示出它在检测目标类别时的优秀能力。相比之下,ResNet50的召回率为93.75%,与ResViT模型的召回率相比略逊一筹。关于F1评分,ResViT和ResNet50模型分别达到了0.95和0.93,表明它们在精确度和召回率之间取得了良好的平衡,能够在保持高精度的同时减少误报和漏报的概率。这也表明即使数据集中可能存在数据偏差,仍能准确完成分类任务。VGG19模型的F1评分也较高,但和ResViT与ResNet50相比仍然存在差距。在训练时长方面,ResViT稍比ResNet50用时长,但只有VGG19的一半。AlexNet用时最短。总体上,ResViT模型在各项指标上表现均突出,显示了较高的实用价值。虽然在训练时长方面不是最快的,但从准确率等其他结果来看,其优势比较全面。
表 1 4种模型实验结果Table 1. Experimental results obtained using the four models模型
Model训练集平均准确率
Training set average
accuracy/%验证集平均准确率
Verification set average
accuracy/%测试集准确率
Test set
accuracy/%平均召回率
Average recall
rate/%F1评分
F1
rating训练时长
Training
durationAlexNet 78.20 81.05 19.09 6.25 0.02 66 h 28 min ResNet50 96.78 96.97 92.73 93.75 0.93 135 h 28 min VGG19 91.78 94.22 80.91 79.82 0.81 300 h 56 min ResViT 97.02 97.25 95.45 96.32 0.95 158 h 09 min 如图5所示,ResViT模型能基本准确地区分各类样本,仅有少量样本出现错误。如图6所示,ResViT模型的表现最佳,可以快速高效的学习,准确率在10轮以内就超过了90%,并在第20轮左右趋于稳定;ResNet50模型略晚于ResViT模型90%以上的准确率,且波动始终较大,并不平稳;VGG19模型在第10轮左右达到90%的准确率;而AlexNet模型仅有少数几次在验证集上准确率在90%以上,且波动很大,尤其是在第67到70轮,训练损失增大且测试集准确率下降。这种现象通常是过拟合的特征。因此推断其可能出现了过拟合的现象。综上所述,ResViT模型在验证集上的表现优于其他3种模型,其次是ResNet50,表现最差的是AlexNet模型。
综上所述,ResViT模型在草本植物识别分类任务中表现出色,能够达到高准确度,并在短时间内取得良好的训练效果。因此,本研究构建的ResViT模型在小数据集上能够出色地完成分类任务,同时展现出良好的鲁棒性和处理负例的能力。
4. 讨论
Res50Ftr是一种深度卷积神经网络,专注于提取图像的局部特征。通过训练,该模型能够有效地提取图像的边缘信息,并利用卷积块生成高质量的局部特征图。ViTSmall则采用了自注意力机制,通过平移操作,确保即使特征图被分割后仍能保留强大的全局信息。这一机制不仅能够联系附近的上下文,还能捕捉图像中的长距离特征信息。通过独特的Transformer层,ViTSmall可以学习更加全面的特征和高级别的语义信息。ResViT模型将Res50Ftr和ViTSmall的优点结合在一起,既保留了局部特征信息,又不忽视全局特征。因此,它具备强大的学习能力,继承了两个模型的优秀特性。借助ViTSmall的多头自注意力机制,ResViT能够处理不同的特征子空间,增强模型的表达力。优秀的特征提取能力和强大的模型表达力使得ResViT模型在仅需30轮或更少的训练后即可达到一个稳定的状态。因此,ResViT模型展现了优异的性能。
本研究使用的数据集模拟了用户使用手机拍摄的视角和效果,用户可以将训练集中的图像按类别分类后直接输入模型,模型会自动提取和学习相应特征,在测试集上实现准确预测。另一方面,ResViT即使在偏重的小规模数据集上也能保持高效的学习能力和分类准确度,克服了现有模型依赖中、大规模数据集的缺陷。因此,ResViT显著降低了前期数据准备的成本。同时显著提升了训练效率,减少了训练时间。ResViT的建立弥补了草类分类领域研究的不足,并有望在干旱和半干旱城市草地监测中发挥重要作用。
本研究结果还存在一些有待进一步研究的问题。首先,ResViT模型的最大分类能力尚未确定,目前的16类分类是受限于现有设备条件的上限。如果设备性能提升,可以进一步增加分类数量,以测试ResViT模型的分类能力极限。其次,本研究使用的是强优势类占主导的数据集,因此模型在强优势类上的学习能力较为准确。然而,研究结果虽然在弱势类上表现完美,但未能充分测试强势类数据对弱势类学习的影响,可能导致弱势类的学习不足或强势类的学习过剩。此外,由于许多草种的叶片性状和颜色相似,难以通过肉眼区分,需要借助触感、嗅觉等。这些因素是否能够与现有模型结合,以提高特征提取的精度,实现更高水平的草类分类,仍需进一步研究验证。
5. 结论
为了在干旱和半干旱城市草地监测任务中精准快速地识别草的种类,结合ViT和ResNet50的优势构建了混合神经网络模型ResViT。得到以下结论:1) ResViT模型在准确率上超过了AlexNet、ResNet50和VGG19模型。2) ResViT模型在平均召回率和F1评分上优于AlexNet和ResNet50模型。3) ResViT模型的训练时间是VGG19模型的一半。4) ResViT模型在16分类任务中测试集达到了95.45%的准确率和0.95的F1评分。5) ResViT模型在偏重的小规模数据集上展现了优异的性能,显著降低了前期数据准备的成本,同时提升了训练效率减少了训练时间。
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[20] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TGP/11/1 Examining Stability. Geneva: UPOV, 2011.
[21] 新疆植物志编辑委员会. 新疆植物志(第3卷). 乌鲁木齐: 新疆科技卫生出版社, 2011: 258-259. Commissione Redactorum Flora Xinjiangensis. Flora Xinjiangensis (Tomus 3). Urumqi: Xinjiang Science, Technology and Hygiene Publishing House, 2011: 258-259.
[22] 中国科学院植物研究所. 中国主要植物图说(豆科). 北京: 科学出版社, 1985. Institute of Botany of Chinese Academy of Sciences. Illustrations of Major Plants in China (Leguminosae). Beijing: Science Press, 1985.
[23] 常朝阳, 吴振海, 徐朗然. 中国豆科植物——新记录种: 小花红豆草. 植物分类学报, 2006, 44(2): 187-188. doi: 10.1360/aps040137 CHANG C Y, WU Z H, XU L R. Onobrychis micrantha Schrenk, a newly recorded species of Leguminosae from China. Acta Phytotaxonomica Sinica, 2006, 44(2): 187-188. doi: 10.1360/aps040137
[24] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TG/1/3 General Introduction to the Examination of Distinctness, Uniformity and Stability and the Development of Harmonized Descriptions of New Varieties of Plant. Geneva: UPOV, 2002: 9-10.
[25] 李鸿雁, 李志勇. NY/T2946–2916 豆科牧草种质资源描述规范. 北京: 中国标准出版社, 2017. LI H Y, LI Z Y. NY/T2946–2916 Descriptors for Legume Forage Germplasm Resources. Beijing: Standards Press of China, 2017.
[26] 刘志勇, 王威. NY/T 2487–2013 植物品种特异性、一致性和稳定性测试指南 鹰嘴豆. 北京: 中国标准出版社, 2013. LIU Z Y, WANG W. NY/T 2487–2013 Guidelines for the Conduct of Tests for Distinctness, Uniformity and Stability Chick-pea. Beijing: Standards Press of China, 2013.
[27] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TGP/7/1 Development of Test Guidelines. Geneva: UPOV , 2004, 30: 55-56.
[28] 唐浩, 余汉勇, 肖应辉, 魏兴华, 张新明, 陈立云. 基于 DUS 测试的水稻标准品种形态性状多样性分析. 植物遗传资源学报, 2011, 12(6): 853-859. TANG H, YU H Y, XIAO Y H, WEI X H, ZHANG X M, CHEN L Y. Diversity analysis on morphological characteristics of the example varieties based on rice DUS testing. Journal of Plant Genetic Resources, 2011, 12(6): 853-859.
[29] 乔雨, 石凤翎, 张雨桐, 钱亚斯, 闫伟, 伊风艳. 蒙农红豆草花瓣转录组微卫星SSR特征分析. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2020, 48(12): 9-17. QIAO Y, SHI F L, ZHANG Y T, QIAN Y S, YAN W, YI F Y. SSR characteristics of transcriptome of Mengnong saiinfoin. Journal of Northwest A& F University (Nature Science Edition), 2020, 48(12): 9-17.
[30] 申书恒. 红豆草 EST-SSR 分子标记开发与遗传多样性分析. 兰州: 兰州大学硕士学位论文, 2019. SHEN S H. Development of EST-SSR markers and analyses of genetic diversity in sainfoin. Master Thesis. Lanzhou: Lanzhou University, 2019.
-
表 1 供试材料
Table 1 Sainfoin varieties
代号
Number品种名
Name来源
Origin代号
Number品种名
Name来源
Origin代号
Number品种名
Name来源
Origin1 K1 中国内蒙古
Inner Mongolia, China31 GC-14-3 中国新疆
Xinjiang, China61 SPARCETO 美国
United States2 IA0419 中国内蒙古
Inner Mongolia, China32 GC-15 中国新疆
Xinjiang, China62 CPI 63831 美国
United States3 IA0414 中国内蒙古
Inner Mongolia, China33 GC-16-1 中国新疆
Xinjiang, China63 D-1738 美国
United States4 IA0412 中国内蒙古
Inner Mongolia, China34 GC-17 中国新疆
Xinjiang, China64 CPI 63848 美国
United States5 87-172 中国内蒙古
Inner Mongolia, China35 GC-18 中国新疆
Xinjiang, China65 CPI 63766 美国
United States6 87-74 中国内蒙古
Inner Mongolia, China36 GC-19-1 中国新疆
Xinjiang, China66 CPI 63750 美国
United States7 87-7 中国内蒙古
Inner Mongolia, China37 GC-20 中国新疆
Xinjiang, China67 ABY-AM 309.00 美国
United States8 83-401 中国内蒙古
Inner Mongolia, China38 GC-21-4 中国新疆
Xinjiang, China68 RENUMEX 美国
United States9 83-397 中国内蒙古
Inner Mongolia, China39 GC-22 中国新疆
Xinjiang, China69 DLEG 950030 美国
United States10 22-27 中国内蒙古
Inner Mongolia, China40 GC-23 中国新疆
Xinjiang, China70 CPI 63827 美国
United States11 ZXY-147 中国内蒙古
Inner Mongolia, China41 GC-24-8 中国新疆
Xinjiang, China71 WJK 19 美国
United States12 甘肃红豆草
Gansu Sainfoin中国甘肃
Gansu, China42 GC-25 中国新疆
Xinjiang, China72 CPI 63747 美国
United States13 蒙农红豆草
Mengnong Sainfoin中国内蒙古
Inner Mongolia, China43 GC-26-2 中国新疆
Xinjiang, China73 247 美国
United States14 奇台红豆草
Qitai Sainfoin中国新疆
Xinjiang, China44 GC-27-11 中国新疆
Xinjiang, China74 805 美国
United States15 普通红豆草
Common Sainfoin中国新疆
Xinjiang, China45 GC-28-8 中国新疆
Xinjiang, China75 CPI 63791 美国
United States16 高加索红豆草
Caucasus Sainfoin中国内蒙古
Inner Mongolia, China46 CPI 63748 美国
United States76 26177 美国
United States17 顿河红豆草
Dunhe Sainfoin中国新疆
Xinjiang, China47 WKT 9 美国
United States77 CPI 63861 美国
United States18 Z-01 中国新疆
Xinjiang, China48 CRIC 22785 美国
United States78 CPI 63817 美国
United States19 GC-02-2 中国新疆
Xinjiang, China49 CPI 63789 美国
United States79 CPI 63838 美国
United States20 GC-03-8 中国新疆
Xinjiang, China50 TU86-43-03 美国
United States80 R 98 美国
United States21 GC-04 中国新疆
Xinjiang, China51 R 113 美国
United States81 DUKORACTUSHCHII 美国
United States22 GC-05-3 中国新疆
Xinjiang, China52 GIANT 美国
United States82 CPI 63829 美国
United States23 GC-06 中国新疆
Xinjiang, China53 CPI 63810 美国
United States83 Sgusciata 美国
United States24 GC-07 中国新疆
Xinjiang, China54 Zulla 美国
United States84 D-1800 美国
United States25 GC-08 中国新疆
Xinjiang, China55 SPARACIA 美国
United States85 CPI 63779 美国
United States26 GC-09 中国新疆
Xinjiang, China56 CPI 63760 美国
United States86 710 美国
United States27 GC-10 中国新疆
Xinjiang, China57 Line 107 美国
United States87 Shoshone 美国
United States28 GC-11 中国新疆
Xinjiang, China58 CPI 63751 美国
United States88 REMONT 美国
United States29 GC-12 中国新疆
Xinjiang, China59 CPI 63765 美国
United States89 SVEDSKIJ 美国
United States30 GC-13 中国新疆
Xinjiang, China60 OBYJ004 美国
United States90 OBYJ003 美国
United States表 2 红豆草品种DUS测试性状
Table 2 Characteristics of sainfoin varieties in the DUS test
性状代号
Code性状
Characteristic性状类型
Type of characteristic观测方法
Methods of observation基本性状
Basic characteristicChr1 倍性 Ploidy QL VG Chr2 植株:生长习性 Plant: growth habits QN VS Chr3 开花期 Flowering stage QN MG Chr4 茎:花青甙显色 Stem: anthocyanin coloration QL VS Chr5 茎:节间长度 Stem: internode length QN MS Chr6 茎:直径 Stem: diameter QN MS Chr7 叶:绿色程度 Leaf: degree of green QN VG Chr8 叶:小叶数 Leaf: Number of leaflets QN MS Chr9 叶:小叶着生姿态 Leaf: leaflet bearing posture PQ VG Chr10 叶:形状 Leaf: shape PQ VS Chr11 叶:长度 Leaves: length QN MS Chr12 叶:宽度 Leaf: width QN MS Chr13 叶:复叶长度 Leaf: compound leaf length QN MS Chr14 叶:叶柄花青甙显色 Leaf: petiole anthocyanin coloration QL VS Chr15 花:颜色 Flower: color PQ VS Chr16 花:旗瓣颜色(背面) Flower: petal color (back) PQ VS Chr17 花:旗瓣花甙显色(正面)
Flower: petal anthocyanin coloration (front)QL VS Chr18 植株:高度 Plant: height QN MS/VG Chr19 植株:分枝性 Plant: branching QN MS/VG Chr20 穗:长度 Spike: length QN MS Chr21 荚:形状 Pod: shape PQ VS Chr22 荚:棘刺 Pod: thorn QL MG Chr23 荚:颜色 Pod: color PQ VG Chr24 种子:百粒重 Seed: 100 grain weight QN MG Chr25 种子:形状 Seed: shapes PQ VG Chr26 种子:颜色 Seed: color PQ VG Chr27 荚:长度 Pod: length QN MS Chr28 荚:宽度 Pod: width QN MS 选测性状
Selected characteristicChr29 荚:落粒性 Pod: granulation QL MS/VG Chr30 植株:白粉病抗性 Plant: powdery mildew resistance QN VG Chr31 植株:镰孢根腐病抗性 Plant: fusarium root rot resistance QN VG QL、QN和PQ分表代表质量性状、数量性状和假质量性状;MG、MS、VS和VG分别代表群体测量、个体测量、个体目测和群体目测。
QL, QN, and PQ denote qualitative characteristic, quantitative characteristic, and pseudo-qualitative characteristic, respectively; MG, MS, VS, and VG denote group measurement, individual measurement, individual visual measurement, group visual measurement, respectively.表 3 红豆草数量性状的最小值、最大值、平均值、标准差和变异系数
Table 3 Minimum value,maximum value,mean value,standard deviation, and coefficient of variation as quantitative characteristics of sainfoin
性状
Characteristics最小值
Minimum value最大值
Maximum value平均值
Average value标准差
Standard deviation变异系数
Coefficient of variation/%开花期 Flowering stage/d 47.00 63.00 52.74 3.35 6.36 节间长度 Internode length/cm 5.30 24.30 12.48 2.83 22.65 茎直径 Stem diameter/mm 0.88 10.30 4.57 1.19 26.05 小叶数 Number of leaflets 8.00 31.00 17.55 3.44 19.61 叶片长度 Blade length/cm 0.50 3.70 2.28 0.48 21.18 叶片宽度 Blade width/cm 0.20 1.8 0.80 0.21 26.47 复叶长度
Compound leaf length/cm5.30 26.50 13.43 3.14 23.36 株高 Plant height/cm 11.10 125.70 70.80 18.72 26.44 分枝数 Branching 5.00 128.00 30.32 21.40 70.58 穗长度 Spike length/cm 3.20 22.50 11.41 2.96 25.89 荚果长度 Pod length/mm 4.15 9.89 6.43 0.73 11.39 荚果宽度 Pod width/mm 2.69 6.53 4.60 0.52 11.24 百粒重 100 grain weight/g 1.58 2.41 1.97 0.17 8.69 表 4 DUS 测试的性状概况
Table 4 Description of characteristics used in DUS testing
观测部位
Observation
position分组性状
Grouping
characteristic功能分类
Functional classification表达类型分类
Expression type classification性状数
Number基本性状
Basic
characteristics选测性状
Selected
characteristics数量性状
Quantitative
characteristics质量性状
Qualitative
characteristics假质量性状
Pseudo-qualitative
characteristics植株 Plant 3 5 4 1 5 茎 Stem 3 2 1 3 叶 Leaf 8 5 1 2 8 花 Flower 1 3 1 2 3 穗 Spike 1 1 1 果实 Fruit 2 8 1 3 2 4 9 抗性 Resistance 2 2 2 合计 Total 6 28 3 17 6 8 31 表 5 红豆草DUS测试指南标准品种及其使用频率
Table 5 Example varieties and frequency of use
编号
Code品种名
Variety频次
Frequency编号
Code品种名
Variety频次
Frequency1 顿河红豆草 Dunhe Sainfoin 10 8 SVEDSKIJ 2 2 奇台红豆草 Qitai Sainfoin 11 9 TU86-43-03 1 3 ZXY-147 3 10 GIANT 1 4 83-397 1 11 87-172 2 5 Shoshone 1 12 SPARCETO 1 6 蒙农红豆草 Mengnong Sainfoin 10 13 CPI 63748 3 7 甘肃红豆草 Gansu Sainfoin 7 -
[1] 金巨和. 优良牧草-红豆草简介. 甘肃畜牧兽医, 1982(1): 39-44. JIN J H. Introduction to the excellent forage sainfoin. Journal of Gansu Animal Husbandry and Veterinary, 1982(1): 39-44.
[2] 中国科学院中国植物志编辑委员会. 中国植物志(第42卷) (第2分册). 北京: 科学出版社, 1998: 221. Editorial Committee of flora of China of Chinese Academy of Sciences. Flora of China (Vol. 42) (Volume 2). Beijing: Science Press, 1998: 221.
[3] CELIK A, KARAKAYA A, AVCI S. Powdery mildews observed on Onobrychis spp. in Turkey. Australasian Plant Disease, 2011, 6(1): 49-53. doi: 10.1007/s13314-011-0017-7
[4] 李旭谦. 红豆草的特性和栽培技术. 青海草业, 2001, 10(4): 41-42. LI X Q. Characteristics and cultivation techniques of sainfoin. Qinghai Prataculture, 2001, 10(4): 41-42.
[5] 何冬梅. 红豆草的栽培与利用. 当代畜禽养殖业, 2004(9): 28-29. HE D M. Cultivation and utilization of sainfoin. Modern Animal Husbandry, 2004(9): 28-29.
[6] 赵国华. 高产优质豆科牧草红豆草的栽培技术及收获利用. 新疆畜牧业, 2009(6): 52-54. doi: 10.3969/j.issn.1003-4889.2009.06.029 ZHAO G H. Cultivation techniques and harvest utilization of sainfoin with high yield and high quality. Journal of Xinjiang Animal Husbandry, 2009(6): 52-54. doi: 10.3969/j.issn.1003-4889.2009.06.029
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[8] 武慧娟, 张榕, 耿小丽, 李德明, 付萍, 周栋昌, 高占琪, 刘乾. 播种量和行距对甘肃红豆草种子产量及产量构成因素的影响. 草业科学, 2023, 40(12): 3084-3094. doi: 10.11829/j.issn.1001-0629.2022-0363 WU H J, ZHANG R, GENG X L, LI D M, FU P, ZHOU D C, GAO Z Q, LIU Q. Effects of sowing rate and row Spacing on the seed yield and yield component traits of Onobrychis viciaefolia ‘Gansu’. Pratacultural Science, 2023, 40(12): 3084-3094. doi: 10.11829/j.issn.1001-0629.2022-0363
[9] 杨浩, 耿小丽, 武慧娟, 付萍, 周栋昌, 刘乾. 磷肥对甘肃临夏地区红豆草种子生产及土壤养分的影响. 草业科学, 2023, 40(3): 779-785. doi: 10.11829/j.issn.1001-0629.2022-0368 YANG H, GENG X L, WU H J, FU P, ZHOU D C, LIU Q. Effect of phosphate fertilizer on seed yield of Onobrychis viciaefolia and soilin Linxia, Gansu Province. Pratacultural Science, 2023, 40(3): 779-785. doi: 10.11829/j.issn.1001-0629.2022-0368
[10] 刘平. 植物新品种保护知识问答. 北京: 中国农业出版社, 2009: 3-4. LIU P. Questions and Answers on Protection Knowledge of New Plant Varieties. Beijing: China Agriculture Press, 2009: 3-4.
[11] 马世青, 郑学莉. 植物新品种保护基础知识. 北京: 蓝天出版社, 1999: 7-10. MA S Q, ZHENG X L. Basic Knowledge of New Plant Variety Protection. Beijing: Blue Sky Press, 1999: 7-10.
[12] 中国标准出版社, 全国标准化原理与方法标准化技术委员会. 标准化工作导则国家标准汇编. 北京: 中国标准出版社, 2018. Standards Press of China, Standardization Principles and Methods. Guidelines for Standardization Work - Compilation of National Standards. Beijing: Standards Press of China, 2018.
[13] 白殿一. 标准的编写. 北京: 中国标准出版社, 2009. BAI D Y. Writing of Standards. Beijing: Standards Press of China, 2009.
[14] 万靓军, 梁刚. NY/T 4244–2022 农业行业标准审查技术规范. 北京: 中国标准出版社, 2023. WANG L J, LIANG G. NY/T 4244–2022 Technical specifications for review of agricultural industry standard. Beijing: Standards Press of China, 2023.
[15] 王汝锋. GB/T 19557.1–2004 植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南 总则. 北京: 中国标准出版社, 2004: 1-24. WANG R F. GB/T 19557.1–2004 Guidelines for the Conduct of Tests for Distinctness, Uniformity and Stability. Beijing: Standards Press of China, 2004: 1-24.
[16] 农业部植物新品种测试中心, 全国植物新品种标准化技术委员会. 植物新品种特异性、一致性和稳定性审查及性状统一描述总则. 北京: 中国农业出版社, 2007. DUS Testing Center for New Plant Varieties of the Ministry of Agriculture, Testing of New Varieties of Plants. General Rules for Review of Distinctness, Uniformity and Stability of New Plant Varieties and Unified Description of Characteristics. Beijing: China Agriculture Press, 2007.
[17] 农业部植物新品种测试中心, 全国植物新品种测试标准化技术委员会. TGP/7植物新品种测试指南的研制. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2006. DUS Testing Center for New Plant Varieties of the Ministry of Agriculture, Testing of New Varieties of Plants. TGP/7 Development of Testing Guidelines for New Plant Varieties. Beijing: China Agricultural Science and Technology Press, 2006.
[18] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TGP/9/2 Examining Distinctness. Geneva: UPOV, 2015.
[19] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TGP/10/2 Examining Uniformity. Geneva: UPOV, 2019.
[20] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TGP/11/1 Examining Stability. Geneva: UPOV, 2011.
[21] 新疆植物志编辑委员会. 新疆植物志(第3卷). 乌鲁木齐: 新疆科技卫生出版社, 2011: 258-259. Commissione Redactorum Flora Xinjiangensis. Flora Xinjiangensis (Tomus 3). Urumqi: Xinjiang Science, Technology and Hygiene Publishing House, 2011: 258-259.
[22] 中国科学院植物研究所. 中国主要植物图说(豆科). 北京: 科学出版社, 1985. Institute of Botany of Chinese Academy of Sciences. Illustrations of Major Plants in China (Leguminosae). Beijing: Science Press, 1985.
[23] 常朝阳, 吴振海, 徐朗然. 中国豆科植物——新记录种: 小花红豆草. 植物分类学报, 2006, 44(2): 187-188. doi: 10.1360/aps040137 CHANG C Y, WU Z H, XU L R. Onobrychis micrantha Schrenk, a newly recorded species of Leguminosae from China. Acta Phytotaxonomica Sinica, 2006, 44(2): 187-188. doi: 10.1360/aps040137
[24] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TG/1/3 General Introduction to the Examination of Distinctness, Uniformity and Stability and the Development of Harmonized Descriptions of New Varieties of Plant. Geneva: UPOV, 2002: 9-10.
[25] 李鸿雁, 李志勇. NY/T2946–2916 豆科牧草种质资源描述规范. 北京: 中国标准出版社, 2017. LI H Y, LI Z Y. NY/T2946–2916 Descriptors for Legume Forage Germplasm Resources. Beijing: Standards Press of China, 2017.
[26] 刘志勇, 王威. NY/T 2487–2013 植物品种特异性、一致性和稳定性测试指南 鹰嘴豆. 北京: 中国标准出版社, 2013. LIU Z Y, WANG W. NY/T 2487–2013 Guidelines for the Conduct of Tests for Distinctness, Uniformity and Stability Chick-pea. Beijing: Standards Press of China, 2013.
[27] International Union for the Protection of New Varieties of Plants. TGP/7/1 Development of Test Guidelines. Geneva: UPOV , 2004, 30: 55-56.
[28] 唐浩, 余汉勇, 肖应辉, 魏兴华, 张新明, 陈立云. 基于 DUS 测试的水稻标准品种形态性状多样性分析. 植物遗传资源学报, 2011, 12(6): 853-859. TANG H, YU H Y, XIAO Y H, WEI X H, ZHANG X M, CHEN L Y. Diversity analysis on morphological characteristics of the example varieties based on rice DUS testing. Journal of Plant Genetic Resources, 2011, 12(6): 853-859.
[29] 乔雨, 石凤翎, 张雨桐, 钱亚斯, 闫伟, 伊风艳. 蒙农红豆草花瓣转录组微卫星SSR特征分析. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2020, 48(12): 9-17. QIAO Y, SHI F L, ZHANG Y T, QIAN Y S, YAN W, YI F Y. SSR characteristics of transcriptome of Mengnong saiinfoin. Journal of Northwest A& F University (Nature Science Edition), 2020, 48(12): 9-17.
[30] 申书恒. 红豆草 EST-SSR 分子标记开发与遗传多样性分析. 兰州: 兰州大学硕士学位论文, 2019. SHEN S H. Development of EST-SSR markers and analyses of genetic diversity in sainfoin. Master Thesis. Lanzhou: Lanzhou University, 2019.
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